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二代测序

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二代测序服务内容

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二代测序服务项目内容表:

样品处理方法:

标本类型 取样要求 保存温度及送样要求
血液 取足量血?#27721;?#32622;于含有抗凝剂EDTA,并且用液氮预冻过的装血管中,-80°C保存 -80°C,干冰送样
细胞 细胞悬浮,用Pbs清洗两次,离心后去上清,用1mL的Trizol重悬浮,-80°C保存 -80°C,干冰送样
普通样本(组织、粪便、土壤) 新鲜样本取样后直接置于用液氮预冻过的离心管中,重放回液氮中速?#24120;?#28982;后-80°C保存 -80°C,干冰送样
病毒DNA,大量水样 需提取DNA,-80°C保存 -80°C,干冰送样

结果展示:

  图一:差异基因筛选。火山图能够直观的展示具有显著性差异表达的基因数目

  图二:数据质控。测序得到的原始测序序列(Sequenced Reads)或者raw reads,里面含有带接头的、低质量的reads,为了保证信息分析质量,必须对raw reads过滤,得到clean reads,后续分析都基于clean reads。在测序过程中会存在一定的错误率,测序错误率分?#25216;?#26597;可以反映测序数据的质量。

结果展示:

  图三。物种进化树。能够得到属水平前100属的代表序列间的远近关?#23548;?#22312;不同样本间的丰度信息。

  图四:PCA主成分分析。能够最大程度反映样本间差异。如果样本的群落组成越相似,则它们在PCA图中的距离越接近。

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